昆山杜克大学硕士项目是被认可的。昆山杜克大学是由美国杜克大学和中国武汉大学合作举办的一所新兴高校，自2013年起面向全球招生，并有权向毕业生授予中美两国均认可的本科和硕士学位证书。昆山杜克大学的硕士学位证书不仅在国内受到认可，同时也有助于学生申请美国以及其他国家的研究生项目。
此外，昆山杜克大学与杜克大学的紧密合作关系，以及其引进的高水平课程体系和跨学科教育模式，使得其硕士项目在学术质量和研究水平上具有较高的标准，从而进一步增强了其学位的认可度。
综上所述，昆山杜克大学的硕士学位是被广泛认可的，无论是国内还是国际层面，其学位的价值和认可度都在逐步提升中。