当公司面临侵权指控时，可以采取以下步骤进行处理：
协商解决
与被侵权方进行协商，寻求和解，可能包括停止侵权行为、赔偿损失和赔礼道歉等措施。
法律途径
起诉：如果协商不成，被侵权方可以依法向人民法院提起民事诉讼。根据《民事诉讼法》，法院通常会在七日内决定是否受理案件。
仲裁：在某些情况下，双方可以约定通过仲裁解决纠纷。需要提交仲裁申请书，并由仲裁委员会决定是否受理。
风险评估与预防
进行专利检索和分析，确保研发产品不侵犯他人专利。
获取必要的专利许可或所有权，或通过互惠授权避免侵权。
选择不侵犯他人专利的技术和材料。
寻求专业咨询或法律意见，评估产品侵权风险。
侵权责任
根据《侵权责任法》（已废除），公司直接对其法定代表人和其他工作人员的经营活动承担民事责任。
公司作为侵权方，需向受害人承担赔偿责任。
劳动关系中的侵权
员工如在公司中受到侵权，可向劳动行政主管部门投诉，或申请劳动仲裁维权。
处理侵权行为时，应确保遵循法律规定，并考虑采取适当的法律行动以保护公司的合法权益。如果还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告知