水利部直属的事业单位包括但不限于以下这些：
长江水利委员会水文局
主要职能：流域水文站网建设、水文水资源监测、水环境监测评价等。
黄河水利委员会
行政级别：副部级
主要职能：黄河流域水资源综合规划、治理开发等。
淮河水利委员会
机构规格：正厅局级
主要职能：淮河流域水资源综合规划、治理开发等。
海河水利委员会
机构规格：正厅级
主要职能：海河流域水资源综合管理。
珠江水利委员会
机构规格：正厅级
主要职能：珠江流域水资源综合管理。
松辽水利委员会
主要职能：松花江、辽河流域水资源综合管理。
太湖流域管理局
主要职能：太湖流域水资源综合管理。
水利部综合事业局
主要职能：水利科技推广、人才资源开发、国际经济技术合作交流等。
水利部信息中心（水利部水文水资源监测预报中心）
主要职能：全国水利网络安全和信息化行业指导、水文情报预报等。
水利部南水北调规划设计管理局
主要职能：大型调水工程规划设计、南水北调工程运行管理等。
南京水利科学研究院
主要职能：水利交通能源领域基础理论和应用基础科学研究、高新技术开发。
以上信息根据最近更新的资料整理得出，具体事业单位的详细职能和地址可以通过官方渠道进一步查询确认